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产品介绍:Roche 罗氏 KAPA HyperPlus文库构建试剂盒 (Illumina) , 24反应, KK8512

  
      KAPA HyperPlus文库构建试剂盒

  酶切法超能建库

  KAPA HyperPlus试剂盒极大简化了工作流程,文库片段化和文库制备全部可在单管(Single tube)中操作完成。KAPA HyperPlus试剂盒融合了KAPA HyperPrep试剂盒的行业领先的文库构建效率和非凡的文库质量,添加了酶切片段化(enzymatic fragmentation)模块,使得工作流程更加方便、快捷。

  产品特色

  •2.5小时内完成DNA片段化和文库制备

  •从1ng~1µg的灵活DNA起始量

  •新增额外的末端修复和加A尾模块(A-Tailing),提高敏感型应用的测序性能,不改变工作流程

  •更低偏好,测序覆盖度更均一

  •起始量更低,且适用于无PCR扩增(PCR-free)的工作流程

  •针对FFPE样本,具有行业领先的文库转化率(converstion rate)和文库复杂度

  •对于DNA片段大小、接头设计和文库扩增,有多种选择方案

  •具有经过验证的自动化方案,轻松对接多种自动化平台

  •搭配KAPA接头和KAPA HyperPure磁珠,实现文库制备全套解决方案

  HyperPlus提供片段化+文库制备的解决方案

  KAPA HyperPlus DNA文库构建试剂盒包含低偏好性的酶切片段化DNA的模块,可以取代设备昂贵、难以自动化的机械打断DNA的方法。

  •全部流程,包括DNA片段化和文库制备,均在同一个管子(Single tube)中完成,历时仅2.5小时。

  •支持多种来源的DNA和大范围的DNA起始量,包括非常难处理的样本,如FFPE样本

  •可满足多种应用需求,如人全外显子(WES)测序,微生物全基因组测序等

  DNA片段大小可调整,片段化结果可重复性高

  •通过调整片段化时间,文库插入片段大小可调整在150–800 bp之间

  •不同GC含量的DNA和不同的DNA起始量,可重复实现一致大小的插入片段

  左图:不同DNA起始量,得到一致的文库片段大小分布。使用KAPA DNA HyperPlus文库构建试剂盒将各种起始量的大肠杆菌gDNA在37°C进行酶切打断,时间15min或30min。图中样本文库扩增和磁珠纯化后,采用Agilent High Sensitivity DNA Assay检测。

  右图:不同物种、不同GC含量在相同酶切条件下产生一致大小的插入片段。将10 ng、50 ng的百日咳杆菌(68%GC)、艰难梭菌(29%GC)、大肠杆菌(51%GC)、恶性疟原虫(20%GC)或人gDNA进行37°C,5min、15min、45min的酶切片段化反应。无论GC含量和起始量如何,均能产生约700 bp、350 bp和200 bp的平均插入片段大小。

  业界领先的文库得率

  文库转化率(conversion rate)是指起始DNA分子转化为连接了接头,可以被测序的文库分子(library molecule)的百分比(%)。它是文库构建的重要评价指标,将最终决定文库的构建质量和多样性。

  •低起始量样本不再需要特殊文库构建工作流程或试剂

  •低至50 ng的起始样本量即可进行无PCR扩增(PCR-free)工作流程

  •现有和升级的KAPA HyperPlus试剂盒都可以获得最高的连接后产量

  对不同样本起始量,KAPA HyperPlus DNA文库构建试剂盒都能达到最高产量。KAPA DNA HyperPlus文库构建试剂盒(升级版)将起始DNA转化成与接头连接的文库分子的产量比N厂家酶切法建库试剂盒或与Covaris机械打断联合使用的KAPA HyperPrep试剂盒的产量更多。此实验采用适用于所有工作流程的KAPA UDI接头和KAPA HyperPure磁珠(包括N厂家试剂盒),以1ng、10ng和100ng大肠杆菌gDNA制备无PCR扩增(PCR-free)的文库,在连接后使用KAPA文库定量试剂盒定量文库产量。

  优越的测序结果

  •更高的连接后产量可以减少扩增循环数,进一步降低重复率

  •升级版KAPA DNA HyperPlus文库构建试剂盒能够降低测序artifacts,提升灵敏度,从而提升低频突变检测的可信度

  *KAPA HyperPlus(原有版)代表使用HyperPrep末端修复和加A尾酶混合物(原酶);

  KAPA HyperPlus(升级版)代表使用HyperPlus末端修复和加A尾酶混合物(KAPA HyperPlus DNA文库构建试剂盒现包含的一种新酶)。

  最小的序列覆盖偏好

  •与其他酶切片段化方法相比序列的偏好更低

  •更小的偏好会提高测序覆盖的均一性,降低测序成本

  GC偏好比较。通过计算100 bp序列的GC含量并使用Picard CollectGCBiasMetrics为KAPA HyperPlus和N厂家产品绘制序列间的标准化覆盖率,来评估艰难梭菌(左)、大肠杆菌(中)和百日咳杆菌(右)的GC偏好。建库起始量为10 ng。在没有测序偏好的情况下,以标准化覆盖率1为中心的水平分布表示。基因组中GC含量的分布如灰色直方图所示。

  1来源:Haile,et al.(2019)Sources of erroneous sequences and artifact chimeric reads in next generation sequencing of genomic DNA from formalin-fixed paraffinembedded samples.Nucleic Acids Research,2019,47,2.doi:10.1093/nar/gky1142。

  文件数据

  仅供研究,不用于临床诊断。

  Kapa为罗氏商标。所有其他商标为其各自所有者的财产。

  MC-CN-02070,有效期至2025年3月22日

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